实验室建设的主要目标就是为科研创造有利条件，保护人体、仪器、设备、样品和数据的安全，因此，安全系统建设十分重要。
　　1、将实验室区域与办公区域分开。办公大厅设有准入系统，凭卡入内。不同实验室进行不同级别的准入授权及门禁控制，便于实验室控制与管理。
　　2、办公区域和实验区域分开，主实验区与辅助实验区分开；
　　3、清洁区、污染区分开，人流、物流和污物流分开，以保障样品无交叉污染，保证实验数据的正确性；
　　4、预处理室和仪器分析室分开；不同种类的样品处理室分开；不同种类可能相互干扰的仪器室分开；
　　5、根据实验科目和实验流程，对主实验室和辅助实验室进行协调布置。
　　6、在实验区域设计紧急冲淋、洗眼装置和急救药箱等，减少实验人员的危险。
　　7、精密仪器采用双电源供供电，独立接地保护。
　　8、在用材选择上严格控制，针对不同功能的空间使用符合要求的耐腐蚀材料，对各类产品的结构进行优化设计，使其使用寿命及稳定性均达到国内先进实验室的水平。
　　9、实验室产生的废气应分类、分系统收集，经处理达到国家有关排放标准后高空排放。
　　10、实验室产生的废液和固体废弃物分类收集，交由有资质的相关单位处理。仪器洗涤和洗手产生废水应单独收集处理达标后排放。
　　11、在常温常压下易爆、易燃及排出有毒气体的危险废物必须进行预处理，使稳事实上后贮存，否则，按易爆、易燃危险品贮存。
　　12、在常温常压下不水解、不挥发的固体危险废物可在贮存设施内分别堆放。
　　13、禁止将不相容（相互反应）的危险废物在同一容器内混装。
　　14、无法装入常用容器的危险废物可用防漏胶袋等盛装。
　　15、装载液体、半固体危险废物的容器内须留足够空间，容器顶部与液体表面之间保留100mm以上的空间。
　　16、精密仪器室、生物安全实验室和恒温恒湿实验室等特殊实验室应安装火灾感应系统（如烟感、温感等），严禁安装自动水喷淋系统，应采用气体灭火器、1211灭火器等。